Infeksi oportunistik atau biasa disingkat IO, adalah infeksi yang biasa muncul pada ODHIV yang tidak menjalani terapi ARV dan berada di stadium lanjut yang biasanya jumlah CD4 rendah dibawah 200 sel/mm³. ODHIV dengan jumlah CD4 rendah tersebut memang sangat rentan terkena infeksi oportunistik dan rentan terinfeksi seperti patogen dari virus, bakteri, jamur dan protozoa yang meliputi : Toxoplasma gondii ,  Pneumocystis jirovecii (sebelumnya Pneumocystis carinii ),  Cryptococcus neoformans , Mycobacterium avium , Mycobacterium tuberculosis , Cytomegalovirus, Herpes simplex viruses, Histoplasma capsulatum.

Infeksi oportunistik akan muncul pada ODHIV yang mengalami penekanan/pengurangan jumlah CD4 tergantung pada tingkatnya berdasarkan kategori jumlah CD4 ODHIV berikut : 

Semua jumlah CD4

Mycobacterium tuberculosis: Setelah terinfeksi TB,TB akan bertahan selama bertahun-tahun dan ini disebut infeksi laten yang tanpa menimbulkan gejala dan mengganggu kesehatan. Organisme ini dapat melibatkan setiap sistem organ. Gejalanya meliputi kelelahan, kelemahan, penurunan berat badan, dan demam. Tuberkulosis paru ditandai dengan batuk kronis dan meludah darah. Meningitis dan keterlibatan saluran kemih juga dapat terjadi.

CD4 < 250 sel/mm³

Koksidioidomikosis: Terdiri dari dua spesies,  Coccidioidesimmitis dan  Coccidioides  posadasii , yang ditemukan di tanah. Terdapat empat sindrom berbeda: (1) pneumonia fokal yang disertai demam, batuk, dan nyeri dada pleuritik, (2) pneumonia difus dengan demam, dispnea, hipoksemia, (3) meningitis dengan sakit kepala, lesu, dan (4) tes serologi positif tanpa bukti infeksi lokal.

CD4 < 200 sel/mm³ 

Pneumonia pneumocystis jirovecii (PCP):
Jamur ini, hingga baru-baru ini, dianggap sebagai protozoa. Riwayat demam, dispnea progresif, batuk non-produktif, dan hipoksemia pada pemeriksaan merupakan ciri khasnya. Rontgen dada menunjukkan infiltrat interstisial difus, bilateral, simetris dengan pola kaca buram. 

Kandidiasis mukokutan:
Organisme penyebabnya adalah Candida albicans. Infeksi orofaring muncul sebagai lesi seperti plak berwarna putih, krem, dan tidak nyeri di rongga mulut. Lesi ini mudah dikikis. Cheilosis angular merupakan ciri lainnya. Kandidiasis esofagus dapat muncul dengan nyeri seperti terbakar di retrosternal, odinofagia. Pengujian endoskopik menunjukkan plak putih seperti yang terlihat di rongga mulut. Pada wanita dengan HIV, kandidiasis vulvovaginal muncul dengan rasa terbakar dan gatal pada mukosa vagina. 

CD4 <150 sel/mm³

Histoplasma capsulatum:
Pada individu yang memiliki kekebalan tubuh yang baik, histoplasmosis paru akut ditandai dengan demam, mialgia, menggigil, sakit kepala, dan batuk yang tidak produktif. Gejala-gejala ini dapat saja sembuh sendiri. Pada ODHIV dengan HIV stadium lanjut dan beberapa pasien lanjut usia tanpa HIV, histoplasmosis paru kronis terjadi sebagai proses reaktivasi. Histoplasmosis diseminata yang parah yang bermanifestasi sebagai demam, kelelahan, batuk, penurunan berat badan, limfadenopati, hepatosplenomegali, ulkus mukokutan pada hidung, mulut, lidah, dan usus dapat terjadi. 

CD4 <100 sel/mm³

Kriptokokus neoformans:
Ini adalah infeksi ragi yang ditandai dengan kapsul polisakarida tebal. Dapat bermanifestasi sebagai meningitis subakut atau meningoensefalitis. Demam, malaise (kelelahan), sakit kepala adalah gejala umum yang muncul. Kriptokokosis paru dapat muncul dengan demam, nyeri dada, batuk, dispnea, kultur darah positif. 

Kriptosporidiosis:
Kondisi ini disebabkan oleh protozoa, Cryptosporidium. Biasanya terkait dengan infeksi usus halus dan menyebabkan diare, namun, dalam kondisi imunosupresi berat dapat dikaitkan dengan kriptosporidiosis ekstraintestinal yang parah. Diare encer disertai nyeri perut, mual, dan muntah adalah hal yang umum.  

Virus herpes simpleks (HSV):
ODHIV yang terdiagnosa infeksi HSV yang sering dan parah termasuk penyakit orofaring, keratokonjungtivitis, herpes genital, eksim herpetikum, ensefalitis, dan herpes neonatal. Proktitis HSV, dengan ulkus yang dalam, luas, dan tidak kunjung sembuh, umumnya terlihat pada pasien pria yang berhubungan seksual dengan pasien HIV pria. 

Mikrosporidiosis:
Organisme ini yang ada di mana-mana, terutama zoonosis atau ditularkan melalui air. Banyak spesies dilaporkan menyebabkan infeksi pada manusia. Presentasi klinis berbeda berdasarkan spesies penyebabnya.  Encephalitozoon bieneusi  dapat menyebabkan diare, malabsorpsi, dan kolangitis.  E. cuniculi menyebabkan hepatitis, ensefalitis, dan penyakit yang menyebar. E. intestinalis  dapat menyebabkan diare, infeksi yang menyebar, dan keratokonjungtivitis superfisial.  E. hellem dapat menyebabkan keratokonjungtivitis superfisial, sinusitis, abses prostat, dan infeksi yang menyebar. Anncaliia dan Trachipleistophora menyebabkan keratokonjungtivitis, miositis. Trachipleistophora dapat menyebabkan ensefalitis dan penyakit yang menyebar. 

Infeksi virus JC:
Dimanifestasikan sebagai leukoensefalopati multifokal progresif (PML). Penyakit ini ditandai dengan demielinasi fokal. Gejalanya bervariasi berdasarkan area otak yang terlibat dan dapat berkisar dari kelemahan pada satu ekstremitas hingga hemiparesis, afasia. Saraf optik tidak pernah terlibat, dan jarang memengaruhi sumsum tulang belakang. PML dapat berkembang sebagai respons terhadap pemulihan kekebalan sekunder akibat dimulainya terapi ARV. Pasien-pasien ini dapat memiliki ciri-ciri atipikal termasuk efek massa dari lesi PML dengan edema di sekitarnya yang disebut sebagai PML inflamasi. Demam dan sakit kepala tidak khas dan dapat menunjukkan adanya infeksi oportunistik yang terjadi bersamaan. Kejang dapat terjadi ketika lesi berada di dekat korteks.

CD4 < 50 sel/mm³

Sitomegalovirus:
Manifestasi yang paling umum adalah retinitis. Gejala lain seperti kolitis, esofagitis, ventrikuloensefalitis juga ada. Pneumonitis CMV tidak umum terjadi. 

Ensefalitis Toksoplasma gondii:
Ini adalah protozoa koksidia yang tersebar di seluruh dunia. Ensefalitis fokal adalah manifestasi klinis yang paling umum. Gejala demam, kebingungan, sakit kepala, atau kelemahan motorik harus segera ditangani.

Infeksi yang terjadi bersamaan dengan HIV

Sipilis:
Manifestasinya mirip dengan pasien tanpa infeksi HIV. Sifilis primer muncul sebagai nodul soliter tanpa rasa sakit pada titik kontak yang dengan cepat mengalami ulserasi membentuk chancre. Namun, lesi primer mungkin tidak ada pada pasien HIV. Sifilis sekunder, yang biasanya muncul 2 hingga 8 minggu setelah inokulasi dapat menyebabkan lesi mukokutan, disertai demam, malaise, sakit kepala, dan limfadenopati. Kondiloma lata dapat terjadi yang merupakan lesi papular yang datar dan lembab di area intertriginosa yang hangat. Hepatitis, pneumonia, sindrom nefrotik telah dilaporkan. Sifilis tersier melibatkan sistem kardiovaskular dan penyakit gusi yang memengaruhi sistem organ apa pun. Neurosifilis dapat terjadi pada semua tahap sifilis. Manifestasinya meliputi kelainan saraf kranial, stroke. Meningitis dan uveitis bersamaan mungkin lebih umum terjadi pada pasien HIV. 

Infeksi virus papiloma manusia (HPV):
Faktor risiko utama kanker serviks. Sebagian besar  ditandai dengan infeksi mukosa yang menyebabkan kutil kelamin, anus, dan mulut. Kutil ini berupa pertumbuhan datar, papular, atau bertangkai pada mukosa epitel. Kutil ini biasanya tidak bergejala. Neoplasia intraepitelial dapat bermanifestasi sebagai perdarahan, nyeri, atau massa yang teraba. 

Infeksi virus hepatitis B:
Ini adalah penyebab utama penyakit hati kronis. Infeksi akut tidak bergejala pada sekitar 70% pasien dan menyebabkan gagal hati fulminan pada kurang dari 1%. Gejalanya meliputi mual, muntah, nyeri perut terutama di kuadran kanan atas, demam, dengan atau tanpa penyakit kuning. Pada pasien dengan infeksi HIV, ada risiko lebih tinggi terkena infeksi HBV kronis, yang didefinisikan sebagai deteksi HBsAg yang terus-menerus pada dua kesempatan berbeda dengan jarak 6 bulan. Manifestasi lanjut meliputi sirosis hati dan karsinoma hepatoseluler.

Infeksi virus Hepatitis C:
Gejalanya minimal pada infeksi akut dan kronis. Gejalanya ditandai dengan demam ringan, nyeri perut di kuadran kanan atas, mual, muntah, dan anoreksia disertai penyakit kuning. Komplikasi jangka panjang meliputi sirosis, yang terlihat pada sekitar 20% pasien dengan infeksi HCV kronis dalam 20 tahun setelah infeksi. 

Agar ODHIV yang sehat terhindar dari infeksi oportunistik bisa menjaga kepatuhan terapi ARV agar CD4 jumlahnya tidak menurun dan bisa bertambah seiring waktu dan bagi yang memulai terapi ARV pada stadium lanjut bisa kembali pulih jumlah CD4 agar kualitas kesehatan bisa seperti orang tanpa HIV dan yang terpenting tidak menularkan secara seksual. Dan bagi yang belum terapi ARV bisa segera memulainya tanpa menunggu CD4 menjadi rendah dengan mempertimbangkan manfaat terapi ARV.